V průběhu výstavby působil ENERGOPROJEKT PRAHA jako autorský dozor investora dohlížející na projektové změny v rámci výstavby. Po uvedení JE Dukovany do provozu působí ENERGOPROJEKT PRAHA v rámci lokality jako významný dodavatel v oblasti technických pomocí, úprav úvodního projektu, zpracování projektové dokumentace pro povolení záměru ke změnám, zpracování dokumentace pro provádění stavby, odborných posudků, bezpečnostní dokumentace, implementace stress test opatření, všechny etapy zvyšování výkonu bloku a účasti na periodickém hodnocení bezpečnosti.